Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Laufende Studien-, Bachelor-, Magister-, Master- und Diplomarbeiten

Masterarbeiten

Julian Muders: Implementing a gap-invariant distance measure in ClaSP (Expose)
Masterarbeit
May 2024
Betreuung: Patrick Schäfer, Ulf Leser
Valentin Noske: NGS-based phenotype determination in sepsis patients with machine learning methods (Expose)
Bachelorarbeit Wirtschaftsinformatik
May 2024
Betreuung: Ulf Leser, Knut Reinert
Dan Plischke: Leveraging Active Learning for Few-Shot Relation Extraction using Large Language Models in the Biomedical Domain (Expose)
Bachelorarbeit Wirtschaftsinformatik
January 2024
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik

Studienprojekte / Bachelorarbeiten

Friedrich Tschirpke: Online Tarema: Learning Task and Infrastructure Characteristics at Workflow Runtime (Expose)
Bachellorarbeit Informatik
May 2024
Betreuung: Ulf Leser, Odej Kao
Felix Kummer: Scientific Workflow Partitioning for Federated Execution (Expose)
Studienproject Informatik
April 2024
Betreuung: Ulf Leser, Xing Wang
Duy Le Thanh: Biomedical Information Retrieval using large scale PubMed References (Expose)
Studienproject Informatik
April 2024
Betreuung: Ulf Leser, Xing Wang
Elias Gürlich: Extraktion dogmatischen Wissens aus Gesetzeskommentaren mit der Hilfe von Large Language Models (LLMs) (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
March 2024
Betreuung: Ulf Leser, Axel Metzger
Marc Spitzner: Denoising Diffusion Probabilistic Models as image encoders for vision-language tasks in remote sensing (Expose)
Studienproject Informatik
March 2024
Betreuung: Ulf Leser, Pedram Ghamisi
Marc Schatz: Recurrent Neural Networks: a promising approach to predict spike times of a single neuron in comparison to biophysical models (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
March 2024
Betreuung: Ulf Leser, Susanne Schreiber
Mario Jäckle: LLM based translations of nf*core workflows to snakemake (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
February 2024
Betreuung: Ulf Leser, Thomas Kosch
Ronja Spiegelberg: Wörterbuch-basierte Normalisierung biologischer Entitäten (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
January 2024
Betreuung: Ulf Leser, Henning Meyerhenke
Florian Friederici: Memory thrifty workflow resource assignment (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
January 2024
Betreuung: Ulf Leser, Henning Meyerhenke
Niyaz Huseyn-zada: Multivariate Motif Discovery with Motiflets (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
November 2023
Betreuung: Patrick Schäfer, Matthias Weidlich
Anika Ilieva: Evaluating Dilated Time Series Segmentation in ClaSP (Expose)
Studienprojekt Informatik
November 2023
Betreuung: Patrick Schäfer
Kay Steinbauer: Erweiterung des HunFlair-Frameworks zur Erkennung genetischer Varianten in biomedizinischen Texten (Expose)
Studienprojekt Informatik
Februar 2023 - August 2023
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik