Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Wissensmanagement in der Bioinformatik

Prof. Dr. Ulf Leser

07.04.2021: Im Sonderforschungsbereich FONDA ist eine SHK Stelle (40h/Monat) zu Forschungsarbeiten zu Workflowsystemen zu besetzen
18.03.2021: FONDA is organizing a workshop on Sustainable Data Analytics at the Annual meeting of the German Society for Computer Science. The call for paper is open!
16.03.2021: Our contribution to the BioNLP 2021 shared task on Question Summarization achieved a superb second position among 23 submissions. Congratulations especially to Mario and Leon.
09.03.2021: Informationen zur Lehre im Sommersemester 2021: Algorithmen und Datenstrukturen, Information Retrieval, und Workflowsysteme zur Analyse wissenschaftlicher Daten
07.01.2021: Was wir forschen: Schnelle Erdbebenwarnung mit künstlicher Intelligenz
26.06.2020: The FONDA web site went life. App. 25 research positions (PhD students and PostDocs) will be opened soon. Preliminary information can be found here.
29.05.2020: The German Research Council has approved funding of the Collaborative Research Center (CRC) 1404 "FONDA - Foundations of Workflows for Large-Scale Scientific Data Analysis" (see press release.
2.10.2018: Interview mit Prof. Leser (auf Deutsch) zur Frage KI in der Krebstherapie.
03.05.2018: An was wir forschen: Suchmaschinen für die personalisierte Onkologie

Alle Lehrveranstaltungen des Lehrstuhls
Offene, laufende und abgeschlossene (2020, 2019, 2018, 2017, 2016, früher) Studien- und Diplomarbeiten
- Best thesis award 2018, L. Weber
- Best thesis award 2016, M. Sänger
- Best thesis award 2013, T. Rocktäschel
Lehrbuch Informationsintegration (inklusive Folien und Errate).
Auswertung der Studentenbefragung vom Dezember 2004

Running projects
Finished projects
Software and downloads
Finished dissertations in the group
All publications; latest:
- Münchmeyer et al.: Earthquake magnitude and location estimation from real time seismic waveforms with a transformer network, Geophysical Journal International
- Kittner et al.: Annotation and Initial Evaluation of a Large Annotated German Oncological Corpus, JAMIA Open
- Weber et al.: HunFlair: An Easy-to-Use Tool for State-of-the-Art Biomedical Named Entity Recognition. Bioinformatics
- Münchmeyer et al.: The transformer earthquake alerting model: A new versatile approach to earthquake early warning, GJI