Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Lehrveranstaltungen Wissensmanagement in der Bioinformatik

  • Sommersemester 2023
    • Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 10 SP)
      Bachelor
    • Übung zu Algorithmen und Datenstrukturen (Antipov, Berner, Schäfer)
    • Seminar Scheduling of Scientific Workflows (Leser, 5 SP)
      Master
  • Wintersemester 2022/2023
    • Data Science mit Python (Schäfer, 5 SP), Bachelor
    • Übung zu Data Science mit Python (Schäfer)
    • Seminar: Algorithmen und Methoden der Zeitreihenanalyse (Schäfer), Master
    • Semesterprojekt: Datenerhebung und Analyse menschlicher Prozesse (Ermshaus), Bachelor
  • Sommersemester 2022
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP), Bachelor
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Leser), Bachelor
    • Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer, 5 SP), Bachelor
    • Übungen Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer)
    • Seminar: Algorithmen und Methoden der Zeitreihenanalyse (Schäfer), Bachelor
  • Wintersemester 2021/2022
    • Informationsintegration (Leser, 10 SP)
    • Übung zu Informationsintegration (Ermshaus)
    • Data Science mit Python (Schäfer, 5 SP), Bachelor
    • Übung zu Data Science mit Python (Schäfer)
    • Seminar: Algorithmen und Methoden der Zeitreihenanalyse (Schäfer), Master
    • Seminar: Management und Analyse von Provenancedaten (Leser), Bachelor
    • Semesterprojekt: Entwicklung einer semantischen Suchmaschine für klinische Studien (Sänger), Bachelor
  • Sommersemester 2021
    • Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 10 SP)
      Bachelor
    • Übung zu Algorithmen und Datenstrukturen (Sänger, Ermshaus, Angriman, Nelles)
    • Information Retrieval (Leser, 5 SP)
      Bachelor
    • Übung zu Information Retrieval (Garda)
    • Seminar Workflows for Scientific Data Analysis (Leser, 5 SP)
      Master
  • Wintersemester 2020/2021
    • Data Warehousing and Data Mining (Schäfer, 10 SP)
      Master
    • Übung zu Data Warehousing and Data Mining (Schäfer)
    • Einführung in Digital Health (Starlinger, 5 SP)
      Bachelor
    • Übung zu Einführung in Digital Health (Starlinger)
    • Seminar Neue Entwicklungen im Deep Learning (Münchmeyer, Weber, 5 SP)
      Master
  • Sommersemester 2020
    • Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer, 5 SP)
      Bachelor
    • Übungen Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
      Bachelor
    • Seminar Klassifikation Biomedizinischer Texte (Sänger, 5SP)
      Master
  • Wintersemester 2019/2020
    • Implementierung von Datenbanken (Leser, 10 SP)
      Master
    • Übung zu Implementierung von Datenbanken (Schäfer)
    • Seminar Transfer Learning for Biomedical Relation Extraction (Sänger, 5SP)
      Master
    • Seminar Similarity Search (Leser, 3 SP)
      Bachelor
  • Sommersemester 2019
    • Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 9 SP)
      Bachelor
    • Übungen Algorithmen und Datenstrukturen (Sänger, Schäfer, Hegerfeld, Angriman)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
      Bachelor
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Otto)
    • Proseminar Wissenschaftliches Arbeiten (Leser, 3SP)
      Bachelor
  • Wintersemester 2018/2019
    • Algorithmische Bioinformatik (Leser, 10 SP)
      Master
    • Übung zu Algorithmische Bioinformatik (Otto)
    • Maschinelle Sprachverarbeitung (Leser, 5 SP)
      Bachelor
    • Übung zu Maschinelle Sprachverarbeitung (Sänger)
    • Semesterprojekt Implementierung eines Brettspiels (Schäfer, Leser, 10SP)
      Bachelor
    • Seminar Landnutzungsklassifikation - als Wettbewerb (Schäfer, 5 SP)
      Master
  • Sommersemester 2018
    • Modul Information Retrieval (Leser, 5 SP)
      Bachelor Informatik, Bachelor INFOMIT
    • Übung zu Information Retrieval (Sänger)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
      Wahlpflichtbereich Monobachelor Informatik
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Otto)
    • Proseminar Wissenschaftliches Arbeiten (Leser, 3SP)
      Wahlpflichtbereich Monobachelor Informatik, Kombibachelor Informatik, INFOMIT
  • Wintersemester 2017/2018
    • Modul Data Warehousing and Data Mining (Leser, 10 SP)
      Master Informatik, Wirtschaftsinformatik
    • Übungen Data Warehousing and Data Mining (Schäfer)
    • Modul Maschinelle Sprachverarbeitung (Leser, 5 SP)
      Monobachelor Informatik, Bachelor INFOMIT
    • Übung zu Maschinelle Sprachverarbeitung (Sänger)
    • Seminar Machine Learning for Performance Prediction in Complex Software Systems (Leser, 3SP)
      Monobachelor Informatik
    • Semesterprojekt "Entwicklung einer Suchmaschine für Alternativmethoden zu Tierversuchen" (Leser, 12 SP)
      Bachelor Informatik, INFOMIT
  • Sommersemester 2017
    • Modul Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 9 SP)
      Pflichtmodul Monobachelor Informatik. Bachelorstudiengang INFOMIT, Kombibachelor Informatik im Kern- und Zweitfach
    • Übungen Algorithmen und Datenstrukturen (Bux, Grussien, Heimberg, Schäfer)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Starlinger, 5 SP)
      Wahlpflichtbereich Monobachelor Informatik
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Lichtblau, Starlinger)
    • Proseminar Wissenschaftliches Arbeiten (zwei Termine; beide Leser, 3SP)
      Wahlpflichtbereich Monobachelor Informatik, Kombibachelor Informatik, INFOMIT
    • Seminar Text Klassifikation - als Wettbewerb (Leser, 5SP)
      Master Informatik
  • Wintersemester 2016/2017
    • Modul Implementierung von Datenbanken (Leser, 10 SP)
      Master Informatik, Wirtschaftsinformatik
    • Übungen Implementierung von Datenbanken (Bachmann)
    • Modul Information Retrieval (Leser, 5 SP)
      Bachelor Informatik, Bachelor INFOMIT
    • Übung zu Information Retrieval (Bux)
    • Semesterprojekt Implementierung eines Brettspiels inklusive computergesteuerter Spieler (Schäfer, 12SP)
      Bachelor Informatik, INFOMIT
    • Seminar Computational Analysis of Biomedical Data Sets (Lichtblau, 5SP)
      Master Informatik, Master Biophysik
    • Seminar Datenbanken auf moderner Hardware (Leser, 5SP)
      Master Informatik, Master Wirtschaftsinformatik
  • Sommersemester 2016
    • Modul Informationsintegration (Leser, 10 SP)
      Master Informatik, Wirtschaftsinformatik
    • Übungen Informationsintegration (Lichtblau)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
      Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Lichtblau)
    • Proseminar Wissenschaftiches Arbeiten (Leser, 3SP)
      Bachelor Informatik
  • Wintersemester 2015/2016
    • Modul Algorithmische Bioinformatik (Leser, 10 SP)
      Master Informatik, Diplom Informatik
    • Übungen Algorithmische Bioinformatik (Mayer)
    • Seminar Algorithms for Large Graphs (Bux, 5SP)
      Master Informatik, Diplom Informatik
    • Semesterprojekt Verteilte Echtzeit Recherche in Genomdaten (Leser und Bux, 12SP)
      Monobachelor Informatik
    • Modul Maschinelle Sprachverarbeitung (Leser, 5 SP)
      Master Informatik
    • Übungen Maschinelle Sprachverarbeitung (Leser)
  • Sommersemester 2015
    • Modul Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 9 SP)
      Pflichtmodul Monobachelor Informatik. Bachelorstudiengang INFOMIT, Kombibachelor Informatik im Kern- und Zweitfach
    • Übungen Algorithmen und Datenstrukturen (Bux, Grussien, Suermli, Wandelt)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
      Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Leser, Starlinger)
    • Seminar Informatik in der Medizin (Starlinger, 3SP)
      Bachelor Informatik
  • Wintersemester 2014/2015
    • Modul Data Warehousing und Data Mining (Leser, 8 SP)
      Diplom Informatik; Master Informatik, Master Wirtschaftinformatik
    • Übung zu Data Warehousing und Data Mining (Wandelt)
    • Modul Information Retrieval (Leser, 5 SP)
      Monobachelor Informatik, Monobachelor INFOMIT
    • Übung zu Information Retrieval (Leser)
    • Seminar Infrastrukturen für BIG DATA Anwendungen (Leser, 5 SP)
      Master Informatik, Master Wirtschaftsinformatik
  • Sommersemester 2014
    • Modul Informationsintegration (Wandelt, 10 SP)
      Master of Science Informatik, Diplom Informatik
    • Übungen Informationsintegration (Wandelt)
    • Modul Grundlagen der Bioinformatik (Childs, 5 SP)
      Bachelor Informatik, Bachelor Biophysik
    • Übungen Grundlagen der Bioinformatik (Childs)
  • Wintersemester 2013/2014
    • Modul Algorithmische Bioinformatik (Leser, 10 SP)
      Master of Science Informatik, Diplom Informatik
    • Übungen Algorithmische Bioinformatik (Thomas)
    • Seminar Algorithms for Large Graphs (Leser, 3SP)
      Monobachelor Informatik, Diplom Informatik
    • Interdisziplinäres Seminar Computergestützte Analyse von Sprache (Leser und Lüdeling, 5SP)
      Master of Science Informatik, Master Linguistik, Diplom Informatik
    • Semesterprojekt Semantic Text Browsing (Leser und Thomas, 12SP)
      Monobachelor Informatik
    • Modul General Game Playing (Wandelt, 5 SP)
      Master of Science Informatik
    • Übungen General Game Playing (Wandelt)
  • Sommersemester 2013
    • Modul Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 9 SP)
      Pflichtmodul Monobachelor Informatik. Bachelorstudiengang INFOMIT, Kombibachelor Informatik im Kern- und Zweitfach
    • Übungen Algorithmen und Datenstrukturen (NN)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
      Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Thomas)
    • Seminar Similarity Search (Leser, 5SP)
      Seminar Master of Science Informatik, Diplom Informatik
    • Seminar Angewandtes Text Mining (Thomas, 5SP)
      Seminar Master of Science Informatik, Diplom Informatik
  • Wintersemester 2012/2013
    • Modul Text Analytics (Leser, 10 SP)
      Master Informatik und Wirtschaftsinformatik; Diplom Hauptstudium
    • Übungen Text Analytics (Thomas)
    • Modul Implementierung von Datenbanksystemen (Leser, 10SP)
      Master Informatik und Wirtschaftsinformatik; Diplom Hauptstudium
    • Übung zu Implementierung von Datenbanksystemen (Koschmieder)
    • Modul Grundlagen des Semantic Web (Wandelt, 5 SP)
      Master Informatik und Wirtschaftsinformatik
    • Übung zu Grundlagen des Semantic Web (Wandelt)
    • Seminar Maschinelles Lernen (Leser, 3 SP)
      Monobachelor Informatik, Diplom Hauptstudium Praktische Informatik
  • Sommersemester 2012
    • Modul Informationsintegration (Leser, 8SP)
      Diplominformatik Hauptstudium; Master Wirtschaftsinformatik
    • Übung Informationsintegration (Wandelt)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5SP)
      Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Thomas)
    • Seminar From Genes and Machines - Aktuelle Themen der (algorithmischen) Datenanalyse in der Bioinformatik (Thomas, Zimmermann, Kröger, 3SP)
    • Seminar (Nicht-)Standard-Inferenztechniken im Semantic Web (Wandelt, 3SP)
    • Seminar Large-Scale Distributed Data Analysis (Leser, Rheinländer, Starlinger, 3SP)
  • Wintersemester 2011/2012
    • Modul Data Warehousing und Data Mining
      8SP, Monobachelor Informatik Wahlpflicht; Diplominformatik Hauptstudium; Master Wirtschaftsinformatik
    • Übung Data Warehousing und Data Mining
    • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
      8SP, Diplominformatik Hauptstudium; Master Biophysik Vertiefung
    • Übung Algorithmische Bioinformatik
    • Seminar Data and Text Mining in Social Networks
  • Sommersemester 2011
    • Modul Algorithmen und Datenstrukturen
      8SP, Monobachelor Informatik Pflichtmodul
    • Übung Algorithmen und Datenstrukturen
    • Grundlagen der Bioinformatik
      5SP, Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik
  • Wintersemester 2010/2011
    • Halbkurs Text Analytics
      8SP, Diplominformatik Hauptstudium
    • Praktikum Text Analytics
    • Grundlagen der Bioinformatik
      5SP, Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik
  • Sommersemester 2010
    • Forschungsfreisemeser
  • Wintersemester 2009/2010
    • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
    • Übung Algorithmische Bioinformatik
    • Seminar Moderne Methoden der Informationsintegration
  • Sommersemester 2009
    • Halbkurs Implementierung von Datenbanksystemen (entfällt)
    • Seminar Moderne Methoden zur Informationsintegration (entfällt)
    • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
  • Wintersemester 2008/2009
    • Halbkurs Informationsintegration
    • Praktikum Informationsintegration 1
    • Praktikum Informationsintegration 2
    • Seminar Geospatial Information Retrieval
  • Sommersemester 2008
    • Halbkurs Text Analytics
    • Praktikum Text Analytics
    • Proseminar Einführung in die Bioinformatik
    • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
  • Wintersemester 2007/2008
    • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
    • Übung Algorithmische Bioinformatik
    • Seminar Data Mining in der Bioinformatik
    • Seminar Graphmanagement in Datenbanken
    • Seminar Grundlagen des Projektmanagements
  • Sommersemester 2007
    • Halbkurs Data Warehousing und Data Mining
    • Übung Data Warehousing und Data Mining
    • Seminar Datenmanagement in Sensornetzen
    • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
  • Wintersemester 2006/2007
    • Halbkurs Informationsintegration
    • Praktikum Informationsintegration
    • Seminar Quantitative und qualitative Analyse von Texten
    • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Übung zur Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
  • Sommersemester 2006
    • Forschungsfreisemester
  • Wintersemester 2005/2006
    • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
    • Übung Algorithmische Bioinformatik
    • Seminar Graphmanagement in Datenbanken
    • Seminar Rekonstruktion von Sprachstammbäumen
    • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Übung zur Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
  • Sommersemester 2005
    • Halbkurs Implementierung von Datenbanken
    • Spezialvorlesung Data Warehousing
    • Seminar Algorithmische Bioinformatik
    • Proseminar Klassische Algorithmen der Bioinformatik
  • Wintersemester 2004/2005
    • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
    • Übung Algorithmische Bioinformatik
    • Interdisziplinäres Seminar Verwandtschaft und Abstammung in Zeichenketten
    • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Übung zur Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Ringvorlesung: Grosse Datenmengen in webbasierten Umgebungen
  • Sommersemester 2004
    • Spezialvorlesung Data Warehousing
    • Übung Data Warehousing
    • Spezialvorlesung Molekularbiologische Datenbanken
    • Übung Molekularbiologische Datenbanken (2 SWS)
  • Wintersemester 2003/2004
    • Halbkurs Bioinformatik
    • Seminar Advanced Data Warehousing
    • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Übung zur Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
  • Sommersemester 2003
    • Spezialvorlesung Data Warehousing
    • Übung Data Warehousing
    • Spezialvorlesung Molekularbiologische Datenbanken
    • Übung Molekularbiologische Datenbanken (2 SWS)
  • Wintersemester 2002/2003
    • Seminar Datenintegration in der Bioinformatik