Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Lehrveranstaltungen Wissensmanagement in der Bioinformatik

  • Wintersemester 2025 / 2026
    • Informationsintegration (Leser, 10 SP)
    • Übung zu Informationsintegration (Ermshaus)
    • Data Science mit Python (Schäfer, 5 SP)
    • Übung zu Data Science mit Python (Schäfer)
    • Seminar: Vector Search (Schäfer)
    • Seminar: Sprachmodelle in der Softwareentwicklung (Leser)
  • Sommersemester 2025
    • Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 10 SP), Bachelor
    • Übung zu Algorithmen und Datenstrukturen
    • Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer, 5SP), Bachelor
    • Übung zu Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer)
    • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP), Bachelor
    • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Serbetci), Bachelor
    • Wintersemester 2024 / 2025
      • Algorithmische Bioinformatik (Leser), Master
      • Übung zu Algorithmischer Bioinformatik (Ermshaus), Master
      • Data Warehousing and Data Mining (Schäfer), Master
      • Übung zu Data Warehousing and Data Mining (Schäfer), Master
      • Seminar Workflowsprachen (Leser), Bachelor
      • Seminar Responsible AI (Leser, Serbetci, Wang), Master
    • Sommersemester 2024
      • Statistik und Data Science (Leser), Bachelor
      • Übung zu Statistik und Data Science (Ermshaus et al), Bachelor
      • Information Retrieval (Leser), Bachelor
      • Übung zu Information Retrieval (Schäfer), Bachelor
      • Übung zu Algorithmen und Datenstrukturen (Schäfer et al)
    • Wintersemester 2023 / 2024
      • Implementierung von Datenbanken (Leser, 10 SP), Master
      • Übung zu Implementierung von Datenbanken (Ermshaus)
      • Seminar Energy Saving in Data Analysis (Leser, 3 SP), Bachelor
      • Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer, 5SP), Bachelor
      • Übung zu Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer)
      • Seminar Algorithmen und Methoden der Zeitreihenanalyse (Schäfer, 5 SP), Master
    • Sommersemester 2023
      • Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 10 SP), Bachelor
      • Übung zu Algorithmen und Datenstrukturen (Antipov, Berner, Schäfer)
      • Seminar Scheduling of Scientific Workflows (Leser, 5 SP), Master
    • Wintersemester 2022/2023
      • Data Science mit Python (Schäfer, 5 SP), Bachelor
      • Übung zu Data Science mit Python (Schäfer)
      • Seminar: Algorithmen und Methoden der Zeitreihenanalyse (Schäfer), Master
      • Semesterprojekt: Datenerhebung und Analyse menschlicher Prozesse (Ermshaus), Bachelor
    • Sommersemester 2022
      • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP), Bachelor
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Leser), Bachelor
      • Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer, 5 SP), Bachelor
      • Übungen Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer)
      • Seminar: Algorithmen und Methoden der Zeitreihenanalyse (Schäfer), Bachelor
    • Wintersemester 2021/2022
      • Informationsintegration (Leser, 10 SP)
      • Übung zu Informationsintegration (Ermshaus)
      • Data Science mit Python (Schäfer, 5 SP), Bachelor
      • Übung zu Data Science mit Python (Schäfer)
      • Seminar: Algorithmen und Methoden der Zeitreihenanalyse (Schäfer), Master
      • Seminar: Management und Analyse von Provenancedaten (Leser), Bachelor
      • Semesterprojekt: Entwicklung einer semantischen Suchmaschine für klinische Studien (Sänger), Bachelor
    • Sommersemester 2021
      • Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 10 SP)
        Bachelor
      • Übung zu Algorithmen und Datenstrukturen (Sänger, Ermshaus, Angriman, Nelles)
      • Information Retrieval (Leser, 5 SP)
        Bachelor
      • Übung zu Information Retrieval (Garda)
      • Seminar Workflows for Scientific Data Analysis (Leser, 5 SP)
        Master
    • Wintersemester 2020/2021
      • Data Warehousing and Data Mining (Schäfer, 10 SP)
        Master
      • Übung zu Data Warehousing and Data Mining (Schäfer)
      • Einführung in Digital Health (Starlinger, 5 SP)
        Bachelor
      • Übung zu Einführung in Digital Health (Starlinger)
      • Seminar Neue Entwicklungen im Deep Learning (Münchmeyer, Weber, 5 SP)
        Master
    • Sommersemester 2020
      • Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer, 5 SP)
        Bachelor
      • Übungen Angewandtes Maschinelles Lernen (Schäfer)
      • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
        Bachelor
      • Seminar Klassifikation Biomedizinischer Texte (Sänger, 5SP)
        Master
    • Wintersemester 2019/2020
      • Implementierung von Datenbanken (Leser, 10 SP)
        Master
      • Übung zu Implementierung von Datenbanken (Schäfer)
      • Seminar Transfer Learning for Biomedical Relation Extraction (Sänger, 5SP)
        Master
      • Seminar Similarity Search (Leser, 3 SP)
        Bachelor
    • Sommersemester 2019
      • Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 9 SP)
        Bachelor
      • Übungen Algorithmen und Datenstrukturen (Sänger, Schäfer, Hegerfeld, Angriman)
      • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
        Bachelor
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Otto)
      • Proseminar Wissenschaftliches Arbeiten (Leser, 3SP)
        Bachelor
    • Wintersemester 2018/2019
      • Algorithmische Bioinformatik (Leser, 10 SP)
        Master
      • Übung zu Algorithmische Bioinformatik (Otto)
      • Maschinelle Sprachverarbeitung (Leser, 5 SP)
        Bachelor
      • Übung zu Maschinelle Sprachverarbeitung (Sänger)
      • Semesterprojekt Implementierung eines Brettspiels (Schäfer, Leser, 10SP)
        Bachelor
      • Seminar Landnutzungsklassifikation - als Wettbewerb (Schäfer, 5 SP)
        Master
    • Sommersemester 2018
      • Modul Information Retrieval (Leser, 5 SP)
        Bachelor Informatik, Bachelor INFOMIT
      • Übung zu Information Retrieval (Sänger)
      • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
        Wahlpflichtbereich Monobachelor Informatik
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Otto)
      • Proseminar Wissenschaftliches Arbeiten (Leser, 3SP)
        Wahlpflichtbereich Monobachelor Informatik, Kombibachelor Informatik, INFOMIT
    • Wintersemester 2017/2018
      • Modul Data Warehousing and Data Mining (Leser, 10 SP)
        Master Informatik, Wirtschaftsinformatik
      • Übungen Data Warehousing and Data Mining (Schäfer)
      • Modul Maschinelle Sprachverarbeitung (Leser, 5 SP)
        Monobachelor Informatik, Bachelor INFOMIT
      • Übung zu Maschinelle Sprachverarbeitung (Sänger)
      • Seminar Machine Learning for Performance Prediction in Complex Software Systems (Leser, 3SP)
        Monobachelor Informatik
      • Semesterprojekt "Entwicklung einer Suchmaschine für Alternativmethoden zu Tierversuchen" (Leser, 12 SP)
        Bachelor Informatik, INFOMIT
    • Sommersemester 2017
      • Modul Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 9 SP)
        Pflichtmodul Monobachelor Informatik. Bachelorstudiengang INFOMIT, Kombibachelor Informatik im Kern- und Zweitfach
      • Übungen Algorithmen und Datenstrukturen (Bux, Grussien, Heimberg, Schäfer)
      • Grundlagen der Bioinformatik (Starlinger, 5 SP)
        Wahlpflichtbereich Monobachelor Informatik
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Lichtblau, Starlinger)
      • Proseminar Wissenschaftliches Arbeiten (zwei Termine; beide Leser, 3SP)
        Wahlpflichtbereich Monobachelor Informatik, Kombibachelor Informatik, INFOMIT
      • Seminar Text Klassifikation - als Wettbewerb (Leser, 5SP)
        Master Informatik
    • Wintersemester 2016/2017
      • Modul Implementierung von Datenbanken (Leser, 10 SP)
        Master Informatik, Wirtschaftsinformatik
      • Übungen Implementierung von Datenbanken (Bachmann)
      • Modul Information Retrieval (Leser, 5 SP)
        Bachelor Informatik, Bachelor INFOMIT
      • Übung zu Information Retrieval (Bux)
      • Semesterprojekt Implementierung eines Brettspiels inklusive computergesteuerter Spieler (Schäfer, 12SP)
        Bachelor Informatik, INFOMIT
      • Seminar Computational Analysis of Biomedical Data Sets (Lichtblau, 5SP)
        Master Informatik, Master Biophysik
      • Seminar Datenbanken auf moderner Hardware (Leser, 5SP)
        Master Informatik, Master Wirtschaftsinformatik
    • Sommersemester 2016
      • Modul Informationsintegration (Leser, 10 SP)
        Master Informatik, Wirtschaftsinformatik
      • Übungen Informationsintegration (Lichtblau)
      • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
        Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Lichtblau)
      • Proseminar Wissenschaftiches Arbeiten (Leser, 3SP)
        Bachelor Informatik
    • Wintersemester 2015/2016
      • Modul Algorithmische Bioinformatik (Leser, 10 SP)
        Master Informatik, Diplom Informatik
      • Übungen Algorithmische Bioinformatik (Mayer)
      • Seminar Algorithms for Large Graphs (Bux, 5SP)
        Master Informatik, Diplom Informatik
      • Semesterprojekt Verteilte Echtzeit Recherche in Genomdaten (Leser und Bux, 12SP)
        Monobachelor Informatik
      • Modul Maschinelle Sprachverarbeitung (Leser, 5 SP)
        Master Informatik
      • Übungen Maschinelle Sprachverarbeitung (Leser)
    • Sommersemester 2015
      • Modul Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 9 SP)
        Pflichtmodul Monobachelor Informatik. Bachelorstudiengang INFOMIT, Kombibachelor Informatik im Kern- und Zweitfach
      • Übungen Algorithmen und Datenstrukturen (Bux, Grussien, Suermli, Wandelt)
      • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
        Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Leser, Starlinger)
      • Seminar Informatik in der Medizin (Starlinger, 3SP)
        Bachelor Informatik
    • Wintersemester 2014/2015
      • Modul Data Warehousing und Data Mining (Leser, 8 SP)
        Diplom Informatik; Master Informatik, Master Wirtschaftinformatik
      • Übung zu Data Warehousing und Data Mining (Wandelt)
      • Modul Information Retrieval (Leser, 5 SP)
        Monobachelor Informatik, Monobachelor INFOMIT
      • Übung zu Information Retrieval (Leser)
      • Seminar Infrastrukturen für BIG DATA Anwendungen (Leser, 5 SP)
        Master Informatik, Master Wirtschaftsinformatik
    • Sommersemester 2014
      • Modul Informationsintegration (Wandelt, 10 SP)
        Master of Science Informatik, Diplom Informatik
      • Übungen Informationsintegration (Wandelt)
      • Modul Grundlagen der Bioinformatik (Childs, 5 SP)
        Bachelor Informatik, Bachelor Biophysik
      • Übungen Grundlagen der Bioinformatik (Childs)
    • Wintersemester 2013/2014
      • Modul Algorithmische Bioinformatik (Leser, 10 SP)
        Master of Science Informatik, Diplom Informatik
      • Übungen Algorithmische Bioinformatik (Thomas)
      • Seminar Algorithms for Large Graphs (Leser, 3SP)
        Monobachelor Informatik, Diplom Informatik
      • Interdisziplinäres Seminar Computergestützte Analyse von Sprache (Leser und Lüdeling, 5SP)
        Master of Science Informatik, Master Linguistik, Diplom Informatik
      • Semesterprojekt Semantic Text Browsing (Leser und Thomas, 12SP)
        Monobachelor Informatik
      • Modul General Game Playing (Wandelt, 5 SP)
        Master of Science Informatik
      • Übungen General Game Playing (Wandelt)
    • Sommersemester 2013
      • Modul Algorithmen und Datenstrukturen (Leser, 9 SP)
        Pflichtmodul Monobachelor Informatik. Bachelorstudiengang INFOMIT, Kombibachelor Informatik im Kern- und Zweitfach
      • Übungen Algorithmen und Datenstrukturen (NN)
      • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5 SP)
        Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Thomas)
      • Seminar Similarity Search (Leser, 5SP)
        Seminar Master of Science Informatik, Diplom Informatik
      • Seminar Angewandtes Text Mining (Thomas, 5SP)
        Seminar Master of Science Informatik, Diplom Informatik
    • Wintersemester 2012/2013
      • Modul Text Analytics (Leser, 10 SP)
        Master Informatik und Wirtschaftsinformatik; Diplom Hauptstudium
      • Übungen Text Analytics (Thomas)
      • Modul Implementierung von Datenbanksystemen (Leser, 10SP)
        Master Informatik und Wirtschaftsinformatik; Diplom Hauptstudium
      • Übung zu Implementierung von Datenbanksystemen (Koschmieder)
      • Modul Grundlagen des Semantic Web (Wandelt, 5 SP)
        Master Informatik und Wirtschaftsinformatik
      • Übung zu Grundlagen des Semantic Web (Wandelt)
      • Seminar Maschinelles Lernen (Leser, 3 SP)
        Monobachelor Informatik, Diplom Hauptstudium Praktische Informatik
    • Sommersemester 2012
      • Modul Informationsintegration (Leser, 8SP)
        Diplominformatik Hauptstudium; Master Wirtschaftsinformatik
      • Übung Informationsintegration (Wandelt)
      • Grundlagen der Bioinformatik (Leser, 5SP)
        Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik (Thomas)
      • Seminar From Genes and Machines - Aktuelle Themen der (algorithmischen) Datenanalyse in der Bioinformatik (Thomas, Zimmermann, Kröger, 3SP)
      • Seminar (Nicht-)Standard-Inferenztechniken im Semantic Web (Wandelt, 3SP)
      • Seminar Large-Scale Distributed Data Analysis (Leser, Rheinländer, Starlinger, 3SP)
    • Wintersemester 2011/2012
      • Modul Data Warehousing und Data Mining
        8SP, Monobachelor Informatik Wahlpflicht; Diplominformatik Hauptstudium; Master Wirtschaftsinformatik
      • Übung Data Warehousing und Data Mining
      • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
        8SP, Diplominformatik Hauptstudium; Master Biophysik Vertiefung
      • Übung Algorithmische Bioinformatik
      • Seminar Data and Text Mining in Social Networks
    • Sommersemester 2011
      • Modul Algorithmen und Datenstrukturen
        8SP, Monobachelor Informatik Pflichtmodul
      • Übung Algorithmen und Datenstrukturen
      • Grundlagen der Bioinformatik
        5SP, Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik
    • Wintersemester 2010/2011
      • Halbkurs Text Analytics
        8SP, Diplominformatik Hauptstudium
      • Praktikum Text Analytics
      • Grundlagen der Bioinformatik
        5SP, Biophysik und Monobachelor Informatik, Wahlpflichtbereich
      • Übung zu Grundlagen der Bioinformatik
    • Sommersemester 2010
      • Forschungsfreisemeser
    • Wintersemester 2009/2010
      • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
      • Übung Algorithmische Bioinformatik
      • Seminar Moderne Methoden der Informationsintegration
    • Sommersemester 2009
      • Halbkurs Implementierung von Datenbanksystemen (entfällt)
      • Seminar Moderne Methoden zur Informationsintegration (entfällt)
      • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Wintersemester 2008/2009
      • Halbkurs Informationsintegration
      • Praktikum Informationsintegration 1
      • Praktikum Informationsintegration 2
      • Seminar Geospatial Information Retrieval
    • Sommersemester 2008
      • Halbkurs Text Analytics
      • Praktikum Text Analytics
      • Proseminar Einführung in die Bioinformatik
      • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Wintersemester 2007/2008
      • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
      • Übung Algorithmische Bioinformatik
      • Seminar Data Mining in der Bioinformatik
      • Seminar Graphmanagement in Datenbanken
      • Seminar Grundlagen des Projektmanagements
    • Sommersemester 2007
      • Halbkurs Data Warehousing und Data Mining
      • Übung Data Warehousing und Data Mining
      • Seminar Datenmanagement in Sensornetzen
      • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Wintersemester 2006/2007
      • Halbkurs Informationsintegration
      • Praktikum Informationsintegration
      • Seminar Quantitative und qualitative Analyse von Texten
      • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
      • Übung zur Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Sommersemester 2006
      • Forschungsfreisemester
    • Wintersemester 2005/2006
      • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
      • Übung Algorithmische Bioinformatik
      • Seminar Graphmanagement in Datenbanken
      • Seminar Rekonstruktion von Sprachstammbäumen
      • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
      • Übung zur Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Sommersemester 2005
      • Halbkurs Implementierung von Datenbanken
      • Spezialvorlesung Data Warehousing
      • Seminar Algorithmische Bioinformatik
      • Proseminar Klassische Algorithmen der Bioinformatik
    • Wintersemester 2004/2005
      • Halbkurs Algorithmische Bioinformatik
      • Übung Algorithmische Bioinformatik
      • Interdisziplinäres Seminar Verwandtschaft und Abstammung in Zeichenketten
      • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
      • Übung zur Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
      • Ringvorlesung: Grosse Datenmengen in webbasierten Umgebungen
    • Sommersemester 2004
      • Spezialvorlesung Data Warehousing
      • Übung Data Warehousing
      • Spezialvorlesung Molekularbiologische Datenbanken
      • Übung Molekularbiologische Datenbanken (2 SWS)
    • Wintersemester 2003/2004
      • Halbkurs Bioinformatik
      • Seminar Advanced Data Warehousing
      • Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
      • Übung zur Vorlesung Bioinformatik für Biophysiker
    • Sommersemester 2003
      • Spezialvorlesung Data Warehousing
      • Übung Data Warehousing
      • Spezialvorlesung Molekularbiologische Datenbanken
      • Übung Molekularbiologische Datenbanken (2 SWS)
    • Wintersemester 2002/2003
      • Seminar Datenintegration in der Bioinformatik