Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Übung zur Bioinformatik

Für Studenten des Studiengangs "Theoretische Biophysik und Bioinformatik"
Übung im Wintersemester 2003 / 2004 Prof. Leser, Silke Trißl

Das Blockpraktikum zur Vorlesung Bioinformatik findet im Zeitraum vom 23.2.2004 - 27.2.2004 am Institut für Informatik statt. Ziel des Praktikum ist das in der Vorlesung erworbene Wissen anzuwenden und zu vertiefen. Die vermittelten Konzepte sollen in der Programmiersprache Java umgesetzt werden.

Ort / Zeit:

  • Rudower Chaussee 25, III.213 (Computerpool),
    Montag - Donnerstag von 10 - 17.30 Uhr mit Mittagspause
    Freitag 10 - 12 Uhr

Anmeldung

Bitte melden Sie sich per eMail unter Angabe von

  • Name
  • Matrikelnummer
  • Semester
  • Studiengang
  • ihrem Accountnamen an der HU-Informatik, soweit noch ein Account besteht.
bei Frau Silke Trissl: trissl@informatik.hu-berlin.de

Sollten Sie keinen Account an der HU-Informatik mehr haben (koennte noch von PI-1/2 uebrig sein), dann melden Sie sich bitte an unter: http://www.informatik.hu-berlin.de/~rbg/account.html

Vorbereitung zum Praktikum

Schein und Klausurtermin

Voraussetzung zum Erhalt eines Scheines ist die Teilnahme am Praktikum.

Die Klausur wird im Anschluß an das Praktikum am Freitag, 27.02.2004 von 14 - 15.30 Uhr in Adlershof, Rudower Chaussee 25, Raum III.101, abgehalten.

Themen im Einzelnen

(Ergänzendes Material zur Übung wir auch hier erhältlich sein):
  • Montag:         Einführung in Java, Kennenlernen der Entwicklungsumgebung 'Eclipse'
  • Dienstag:       Dotplots
  • Mittwoch:      Alignment und dynamische Programmierung
  • Donnerstag:  Substitutionsmatrizen
  • Freitag:          Blast und Multiple Sequence alignment im WWW, Klausur