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Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Übung zu Grundlagen der Bioinformatik

Veranstaltung

Diese Übung begleitet die Vorlesung Grundlagen der Bioinformatik und wird auch auf Englisch

Erster Übungstermin ist der 24.4.2014 Dieser Termin ist Pflicht für alle Teilnehmer. Unentschuldigtes Nichterscheinen hat den Ausschluss von der Übung zur Folge.

Ablauf

In der Übung müssen typische Aufgaben im Bereich der Bioinformatik gelöst werden. Dies umfasst sowohl die Neuimplementierung einfacher Verfahren als auch die Verwendung existierender Tools.

Bitte schreiben Sie Ihren Namen und Ihre Matrikelnummer sowohl auf die schriftlichen Abgaben, als auch als Kommentar in ihren Quellcode. Schreiben Sie auch dazu, welche Übungsgruppe Sie besuchen.

Die Implementationsaufgaben sind in Java zu lösen (Version 1.7 oder niedriger). Als Referenzrechner können Sie den Instituts-Rechner gruenau2 verwenden. Bitte stellen Sie sicher, dass ihre Abgabe auf diesem Rechner compiliert und läuft. Abgaben die sich nicht ausführen lassen werden mit 0 Punkten bewertet.

Die Arbeit erfolgt in Gruppen a drei Studierenden. Jede Gruppe muss alle Aufgaben erfolgreich bearbeiten (mindestens 51% der Punkte für jedes Aufgabenblatt). Die Aufgaben werden an einem Übungstermin ausgegeben, und die Lösungen müssen meist zwei Wochen später von einem der Gruppenmitglieder im Rahmen eines kurzen Vortrags dargestellt werden. In dem Vortrag geht es vor allem darum, gesammelte Erfahrungen an die gesamte Zuhörerschaft zu kommunizieren.

Die einzelnen Aufgaben und Termine

Diese Liste wird ständig aktualisiert. Folien zu den Aufgaben und notwendige Daten werden hier veröffentlicht.