Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

In 2023 abgeschlossene Studien-, Bachelor-, und Masterarbeiten

Magister-/ Masterarbeiten

Fabio Barth: Few-shot Learning for Biomedical Event Extraction with large generative language models (Expose)
Masterarbeit Informatik
Februar 2023 - Oktober 2023
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik
Robin Knapp: Bottleneck Network? - How the application of a distributed file system causes resource contention in I/O intensive Data Analysis Workflows. (Expose)
Masterarbeit Informatik
Januar 2023 - Oktober 2023
Betreuung: Ulf Leser, Odej Kao (TU Berlin)
Michael Hirsch: A dilated Matrix Profile (Expose)
Masterarbeit Informatik
März 2023 - Juli 2023
Betreuung: Patrick Schäfer, Tony Bagnall
Alpay Yilmaz: A workflow for scalable benchmarking and hyperparameter tuning of transfer learning methods (Expose)
Masterarbeit Informatik
November 2022- Juni 2022
Betreuung: Ulf Leser, Kerstin Ritter (Charite)
Lukas Schramm: Benchmarking of multi-dimensional in-memory index structures (Expose)
Masterarbeit Informatik
November 2022- Mai 2022
Betreuung: Ulf Leser, Tilmann Rabl (HPI)
Jan Hoffschulte: Entwicklung eines Korrekturmodells für BioNER (Expose)
Masterarbeit Informatik
Juni 2022- Dezember 2022
Betreuung: Ulf Leser, Mario Sänger, Roman Klinger (Stuttgart)

Studienprojekte / Bachelorarbeiten

Orkan Soyyigit: Deep Learning-based Sentiment Analysis of Textual Data using ChatGPT Labeling (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Juli 2023 - Dezember 2023
Betreuung: Ulf Leser, Roland Roller (DFKI Berlin)
Arsenii Gulevich: Rule Based vs. Machine Learning Based Named Entity Recognition Approaches in an Information Extraction Pipeline in the Context of Bibliographic Data on Sphecidae Wasp Family (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Januar 2023 - November 2023
Betreuung: Ulf Leser, Thomas Krause (Linguistik)
Robert Martin: Neural Retrievers for Question Answering Systems in the Biomedical Domain (Expose)
Studienprojekt Informatik
Januar 2023 - Oktober 2023
Betreuung: Ulf Leser, Samuele Garda
Franz Weiss: Klassifikation und Benchmarking von String-Suche Bibliotheken (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Februar 2023 - September 2023
Betreuung: Ulf Leser, Henning Meyerhenke
Martin Kühn: Short-term forecasting of tropical cyclone impacts on the Texan power grid (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Februar 2023 - Mai 2023
Betreuung: Ulf Leser, Mehrnaz Anvari (GFZ Potsdam)
Stefan Krüger: Eigennamen- und Zitaterkennung auf dem deutschsprachigen Rechtstext-Korpus LER mit Transformermodellen in FLAIR (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Februar 2023 - Mai 2023
Betreuung: Ulf Leser, Alan Akbik
Wilhelm Simon: Ad-hoc runtime prediction of scientific workflow tasks - performance comparison of state-of-the-art approaches (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Februar 2023 - Juni 2023
Betreuung: Ulf Leser, Lauritz Thamsen (Glasgow)
Benjamin Waibel: Approximation des k-NN Klassifikators im ClaSP-Algorithmus (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
November 2022 - März 2023
Betreuung: Ulf Leser, Arik Ermshaus
Anna Göing: Availability and access restrictions of cancer patient sequencing profiles for developing precision oncology methods (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Oktober 2022 - Februar 2023
Betreuung: Ulf Leser, Manuela Benary (Charite)
Tim Brückner: Interoperable und maschinenlesbare Darstellung medizinischer Leitlinien (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Oktober 2022 - Februar2023
Betreuung: Johannes Starlinger, Ulf Leser
Tim Patzak: Automatische Klassifikation von Alltagsszenarien mit einem BERT-basierten Siamese-Netzwerk (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Juli 2021- Dezember 2021
Betreuung: Mario Sänger, Ulf Leser, Anke Lüdeling
Jörn-Hagen Stoll: A benchmark and evaluation of Motif set definitions on musical compositions and lyrics (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
November 2022 - März 2023
Betreuung: Patrick Schäfer, Ulf Leser
Jonas Pfeiffer: Open Time Series Classification with TEASER (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
September 2022 - Januar 2023
Betreuung: Patrick Schäfer, Matthias Weidlich
Sebastian Kühn: Open-World Classification (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
September 2022 - Januar 2022
Betreuung: Patrick Schäfer, Ulf Leser
Alina Hartwich: Multivariate time series segmentation with ClaSP (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Juni 2023 - Oktober 2023
Betreuung: Patrick Schäfer, Georgiana Ifrim (Dublin), Arik Ermshaus
Corinna Mackenow: A benchmark and evaluation of motif discovery on audio books (Expose)
Bachelorarbeit Informatik
Juni 2023 - Oktober 2023
Betreuung: Patrick Schäfer, Matthias Weidlich