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Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Abgeschlossene Studien- und Diplomarbeiten in 2011

Diplomarbeiten

Alexandra Rostin: Schnelles und genaues Erkennen von Proteinnamen in Texten (Expose)
Diplomarbeit Informatik
März 2011 - Dezember 2011
Betreuung: Ulf Leser, Jörg Hakenberg
Philipp Hussels: Linking Ontologies using Evidence (Expose)
Diplomarbeit Informatik
September 2010 - September 2011
Betreuung: Silke Trissl
Eric Dießler: Parallelisierung von Text Mining Workflows in einer Cloud (Expose)
Diplomarbeit Informatik
Dezember 2010 - September 2011
Betreuung: Ulf Leser, Volker Markl (TU Berlin)
Marc Bux: Comparing semantically enriched experimental protein networks in colorectal cancer (Expose)
Diplomarbeit Informatik
Februar 2011 - August 2011
Betreuung: Ulf Leser, Nils Blüthgen (Charité Berlin)
Marcel Jentsch: Alternative Splicing Detection Algorithms for Affymetrix Exon Array Data (Expose)
Masterarbeit Bioinformatik (FU Berlin)
Dezember 2010 - Juni 2011
Betreuung: Ulf Leser, Karin Zimmermann
Marco Eckstein: Text Mining for a Database Containing Structured Reports about Nosocomial Outbreaks (Expose)
Diplomarbeit Informatik
Mai 2010 - Oktober 2010
Betreuung: Ulf Leser, Michael Behnke (Charité)
Björn Pollex: Scoring protein function predictions (Expose)
Diplomarbeit Informatik
Mai 2010 - Februar 2011
Betreuung: Ulf Leser, Samira Jaeger, Joachim Selbig (Uni Potsdam)
Astrid Rheinländer: Accurate Long-Read Alignment using Similarity Based Multiple Pattern Alignment and Prefix Tree Indexing (Expose)
Diplomarbeit Informatik
Oktober 2010 - Januar 2011
Betreuung: Ulf Leser, Knut reinert (FU Berlin)

Studien- / Bachelorarbeiten

Sebastian Arzt: The Quality of Protein-Protein Interactions Computationally Extracted from Literature and the Impact on PPI-Applications (Expose)
Studienarbeit Informatik
April 2011 - September 2011
Betreuung: Philippe Thomas, Ulf Leser
Tim Rocktäschel: Single-Step Extraction of Protein-Protein Interactions with Support Vector Machines (Expose)
Studienarbeit Informatik
Februar 2011 - Juni 2011
Betreuung: Ulf Leser, Philippe Thomas