Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Seminar Verwandtschaft und Abstammung in Zeichenketten - Themen

Die Veranstaltung wird als Blockseminar durchgeführt. Die Aufteilung der Themen auf Termine erfolgt nach Vereinbarung.

Datum Vortragende(r) Thema Literatur Betreuer
25.10.2004, 16.00 - 20.00 A. Lüdeling, U. Leser, K. Donhauser, L. Faulstich Themavorstellung und Themenvergabe
Folien zur Einführung, Einige Hinweise zum Vortrag und Seminararbeit, Ansprechpartner und Termine
[NHK99]
[MM03]
[KSS+03]
01.11.2004, 16.00 - 20.00 A. Lüdeling, K. Donhauser Einführung Linguistik und historische Sprachwissenschaft
 
15.11.2004, 16.00-20.00
U. Leser Einführung Bioinformatik, Zeichenketten, und Phylogenie
 
Methoden für den Sprachvergleich mit genetischem Familienkonzept
28.01.2005

9:30-10:15
Helmut Weidner-Kim
Eva Schmeil
Die komparative Methode zur Bestimmung von Sprachfamilien
(Geschichte der historisch-vergleichenden Sprachwissenschaft - erste Wortlisten, Lautgesetze, Rekonstruktion)
Folien - Ausarbeitung
[Cam98]
Lüdeling, Donhauser

10:15 - 11:00
Tobias Schütz
Dorothe Drake
Erstellung und Bewertung von Wortlisten
 (Swadesh-Listen,meaning lists,  wie erkennt man Kognaten, Motiviertheit von sprachlichen Zeichen)
Folien - Ausarbeitung
[Kes01], Kapitel 7-9, [Swa55] Lüdeling

11:00 - 11:45
Gunar Maiwald
Felix Willeke
'Traditionelle' Lexikostatistik
(einfache statistische Modelle, vielleicht ein bisschen Glottochronologie)
Folien - Ausarbeitung
[Kes01], Kapitel 2-6, 10, [Swa55] Lüdeling
Algorithmen zur Bestimmung von Ähnlichkeit auf Zeichenketten

12:45 - 13:30
Gordon Kunkel
Alexander Suhrbier
Ähnlichkeit zwischen Zeichenketten: Edit-Abstand und dynamische Programmierung
Folien - Ausarbeitung
[Gus97], S. 215-235;
[BB03]
Leser

Entfällt Ähnlich ist nicht gleich ähnlich - Substitutionsmatrizen in der Biologie: PAM und Blossum
[HH92]
[DSO78]
[JTT92]
Leser

13:30 - 14:15
Franz Andert
Alexandra Schliephake
Ähnlichkeit in der Linguistik - Phonologie, SAMPA, Lautschrift
Folien - Ausarbeitung
[Kon03]
[NS04]
[HLR+01]
Faulstich
04.02.2005

9:30 - 10:15
Nora Popp
Stefan Pietschmann, Ronny Jurk
Wort- und Satzalignment
Folien - Ausarbeitung
[ON00], [VNT96], [BPM93], [BJM91], Faulstich
Konstruktion von Stammbäumen: Phylogenie


10:15 - 11:00
Stephan Klinger
Benjamin Grossmann
Hierarchisches Clustering: Phylogenetische Algorithmen basierend auf Distanzmassen
Folien - Ausarbeitung
[Gus97], S. 447-458
[EG02], S. 385-397
Leser

11:15 - 12:00
Daniela Fauck
Andreas Wollstein, Michael Himmelsbach
Phylogenetische Algorithmen basierend auf Maximum Parsimony und Maximum Likelihood
Folien - Ausarbeitung
[Gus97], S. 458-470
[EG02], S. 398-404
Leser

12:00 - 12:45
Niklas Hofer Vergleich und Robustheit phylogenetischer Algorithmen
Folien - Ausarbeitung
[Bro01]
[KF95]
Leser
Modellbildung

13:45 - 14:30
Emil Kroymann
Klaus Thoden, Thierno Cmaara
Computational Cladistics
Folien - Ausarbeitung
[RWT02]
([MMoJ])
Lüdeling

14:30 - 15:15
Liliya Gitina
Micaela Mertins, Svetlana Filippova
Sprachkontakt  - Vererbung ist nicht genug
besonders: Sprachbünde (Linguistic Areas)
Folien - Ausarbeitung
[Tho01] und [HSK12], insbesondere [Cam96], [Cou96], [Wil96], [Muy96]
Lüdeling

15:30 - 16:15
Tim Tigges
Marco Hackenberg, Eva Jackolis
'Punctuated Equilibrium'  - ein kombiniertes Modell für genetische Veränderung und Sprachkontakt
Folien - Ausarbeitung
[Dix97]
[Gou02], Kapitel 9
Lüdeling

16:15 - 17:00
Stephan Seigewasser
Marcel Stimberg
Verallgemeinerung: Phylogenetische Netze
Folien - Ausarbeitung
[FTB98] [Hu98]
[NSW+03]
[BD93]
ergänzend:
[FTRR01]
[HF03]
Faulstich

17:00 -
  Abschlussbesprechung