Wissensmanagement in der Bioinformatik
Molekularbiologische Datenbanken
Übungen zur Vorlesung im Sommersemester 2004
Professor Ulf Leser, Silke Trißl
Organisatorisches:
| Zeit: | Mittwoch, von 11-13 Uhr s.t. |
| Ort: | RUD 26, Raum 1'303 (Raumänderung) |
| Sprechzeiten speziell zur Übung: | Montag und Dienstag 10 - 12 Uhr in Raum IV.104 oder nach Vereinbarung |
| Abgabe der Lösungen: | siehe Arbeitsblätter |
Die Bearbeitung der Aufgaben erfolgt in Gruppen a 3 Leute.
Die Übung besteht aus 6 praktischen Aufgaben, für die jeweils 1 - 3 Wochen Zeit zur Bearbeitung sind. In der Übungsstunde werden die Aufgaben besprochen.
Die Ergebnisse der verschiedenen Aufgaben werden pro Gruppe zum Termin der Abgabe in einem Vortrag (etwa 10 Minuten) vorgestellt. Dabei muß jeder der Gruppe mindestens einmal die Ergebnisse präsentieren.
Den Übungsschein erhält jeder, dessen Gruppe alle Aufgaben gelöst hat und der mindestens einmal die Lösung vorgestellt hat.
Zeitplan:
Das Gesamtziel dieser Übung ist das Aufbauen einer Datenbank für Genexpressionsdaten mit experimentellen und integrierten Daten aus anderen Datenbanken. In den verschiedenen Terminen werden jeweils Komponenten dieses Systems erstellt.
| Datum | Titel | Notizen | Aufgabe | Daten | Abgabe |
| 14.04.2004 | Datenbanksuche | Einleitung Datenbankkatalog |
A1 | ||
| 21.04.2004 | Microarray-Modellierung | Microarrays | A2 | A1 | |
| 28.04.2004 | Fragen/Diskussion | ||||
| 05.05.2004 | entfällt |
||||
| 12.05.2004 | Data-Load | zusätzliches Material Einleitung 3 |
A3 | D3 | A2 |
| 19.05.2004 | Fragen/Diskussion | ||||
| 26.05.2004 | Swiss-Prot | SWISS-PROT, Versionierung | A4 | D4 - V1 D4 - V2 |
A3 |
| 02.06.2004 | entfällt |
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| 09.06.2004 | Motiv-Datenbank | Motive in Sequenzen | A5 | D5 | A4 |
| 16.06.2004 | Exkursion zum MPI |
||||
| 23.06.2004 | GO | GeneOntology |
A6 | D6 | A5 |
| 30.06.2004 | Fragen/Diskussion | ||||
| 07.07.2004 | Fragen/Diskussion | ||||
| 14.07.2004 | Abschussveranstaltung | A6 | |||
Last modified: st 2004-06-22