Direkt zum InhaltDirekt zur SucheDirekt zur Navigation
▼ Zielgruppen ▼
 

Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Wissensmanagement in der Bioinformatik

Vorlesung

Molekularbiologische Datenbanken

Übungen zur Vorlesung im Sommersemester 2003
Professor Ulf Leser, Silke Trißl




Organisatorisches:

Zeit: Mittwoch, von 13-15 Uhr
Ort: RUD 25, 1.011
Sprechzeiten speziell zur Übung: Montag und Dienstag 10 - 12 Uhr
 in Raum IV.102
oder nach Vereinbarung
Abgabe der Lösungen: siehe Arbeitsblätter



Die Bearbeitung der Aufgaben erfolgt in 6 - 7 Gruppen a 3 Leute.

Die Übung besteht aus 5 praktischen Aufgaben ab, für die jeweils 1 - 3 Wochen Zeit zur Bearbeitung sind. In der Übungsstunde werden die Aufgaben besprochen.

Die Ergebnisse der verschiedenen Aufgaben werden pro Gruppe zum Termin der Abgabe in einem Vortrag (etwa 10 Minuten) vorgestellt. Dabei sollte jeder mindestens einmal die Ergebnisse präsentieren.

Den Übungsschein erhält jeder, dessen Gruppe alle Aufgaben gelöst hat und der mindestens einmal die Lösung vorgestellt hat.


Zeitplan:

Das Gesamtziel dieser Übung ist das Aufbauen einer Datenbank für Genexpressionsdaten mit experimentellen und integrierten Daten aus anderen Datenbanken. In den verschiedenen Terminen werden jeweils Komponenten dieses Systems erstellt.

Datum Titel Notizen Aufgabe Daten Abgabe
16.04.2003 entfällt
23.04.2003 entfällt
30.04.2003 Datenbanksuche Einleitung
Datenbankkatalog
A1
07.05.2003 Microarray-Modellierung Microarrays A2 A1
14.05.2003 Fragen/Diskussion
21.05.2003 Data-Load Installationsanweisungen
A3 D3 A2
28.05.2003 Fragen/Diskussion
04.06.2003 Swiss-Prot SWISS-PROT, Versionierung A4 D4 - V1
D4 - V2
A3
11.06.2003 Fragen/Diskussion
18.06.2003 Fragen/Diskussion
25.06.2003 GO GeneOntology
A5 D5 A4
02.07.2003 entfällt
09.07.2003 Fragen/Diskussion
16.07.2003 Abschussveranstaltung A5


Last modified: st 2003-03-27