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Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Grundlagen der Bioinformatik

Vorlesung im Sommersemester 2017
Dr. Johannes Starlinger

 

Die Vorlesung behandelt grundlegende Fragestellungen der Bioinformatik. Sie vermittelt zunächst die notwendige Grundkenntnisse in der Molekularbiologie und behandelt dann ausgewählte Themen der Bioinformatik, wie Sequenzierung von Genomen, Vergleich und Suche in DNA Sequenzen, Messung und Interpretation von Genexpressionsexperimenten, Proteomics, Analyse von Protein-Protein-Interaktionsnetzen etc. Sie ist grundlegend konzipiert und führt in die Themen nur ein.

Die Vorlesung wird durch eine Übung begleitet, in die sich Teilnehmer gesondert einschreiben müssen. Die Übung vertieft ausgewählte Methoden der Vorlesung durch deren praktische Umsetzung. Bestehen der Übung ist Voraussetzung zur Prüfungsanmeldung.

Voraussetzungen

Voraussetzung für den Besuch sind grundlegende Kenntnisse in Algorithmen und gute Kenntnisse in Java.

Prüfungen und Anrechenbarkeit

Die Prüfungen erfolgt schriftlich per Klausur am 14.8.2017, Raum 3.001, von 11.30 - 13.30 (Einlass ab 11.00 Uhr). Voraussetzung für die Prüfungsanmeldung ist das Bestehen der Übung.

Die Klausurergebnisse werden durch Aushang an der Pinwand des Lehrstuhls (RUD 25, Haus 4, 4. Stock, links) ab Donnerstag, den 17.8., 10 Uhr veröffentlicht. Die Klausureinsicht kann am Dienstag, den 22.8., in der Zeit von 9 bis 12 Uhr erfolgen.

Informationen zur Studiengängen und Anrechenbarkeit finden Sie in AGNES

Literatur zur Vorlesung

 

  • Gusfield, D. (1997). "Algorithms on Strings, Trees and Sequences", Cambridge University Press.
  • Lesk, A. M. (2008). "Introduction to Bioinformatics", Oxford University Press.
  • Xiong, J. (2006). "Essential Bioinformatics", Cambridge University Press.

 


Themen der Vorlesung

Diese Liste wird ständig aktualisiert. Folien zu den Vorlesungen und notwendige Daten werden hier veröffentlicht.