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▼ Zielgruppen ▼
 

Humboldt-Universität zu Berlin - Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät - Wissensmanagement in der Bioinformatik

Treffen der AG-Textmining in Berlin

BCB BioTeM

AG-Textmining

Treffen am 12. Dezember 2005

Humboldt-Universität zu Berlin


[Programm] - [Teilnehmer] - [Veranstaltungsort] - [Anfahrt] - [Hotels]


Programm

10-13 Uhr Berichte aus den Gruppen: Arbeitspakete zum Thema Annotationsrichtlinien, Analyse GENIA-Korpus
  - Auswahl aus dem Genia-Korpus (JULIE, Joachim Wermter)
  - Annotation durch Studierende der Biologie (JULIE)
  - Inside-/Outside-Statistiken: Worte inner- und ausserhalb von Gennamen (EML, Jasmin Saric)
  - Machine Learning-Ansätze für Fehler (SCAI, Juliane Fluck)
  - wörterbuchbasierte Analyse/NER: Coverage von Proteinnamen (SCAI)
  - wörterbuchbasierte Analyse/NER: Gewebe (BRENDA, Jens Barthelmes)
  - wörterbuchbasierte Analyse/NER: Spezies (HUB, Jörg Hakenberg)
  - Kritik an der GENIA-Ontologie (UKLFR+JULIE, Stefan Schulz, Elena Beißwanger)
11.15 Uhr Kaffeepause
13-14 Uhr Mittagspause
14-17 Uhr Diskussion und nächste Schritte
  - Annotationsrichtlinien von UPenn, Georgetown, Tsujii-Lab (JULIE, Joachim Wermter)
  - Erweiterung der Richtlinien (genestete Entitäten etc.)
  - ggf. Verteilung weiterer Arbeitspakete:
      * Fertigstellung der formalen Definitionen für Konzepte der Genia-Ontologie
      * Analyse der Fehler im Geniakorpus
      * Re-Annotierung des Genia-Fragments durch mehrere Gruppen gleichzeitig
      * Abgleich der neuen Annotationen
  - erste Gedanken über gemeinsame Publikation/Vortrag (SMBM'06 ?)
  - Visualisierung von komplexen Netzwerken (BIOTEC, Loic Royer, Andreas Doms)
  - Termin für das nächste Treffen: Anfang März in Jena
15.15 Uhr Kaffeepause
ab 17 Uhr bei Bedarf: Besprechungen im kleineren Rahmen/Räumen

Veranstaltungsort

Erwin-Schrödinger-Zentrum Humboldt-Universität zu Berlin
Erwin-Schrödinger-Zentrum
Rudower Chaussee 26, Berlin-Adlershof
Vortragsraum 0'101, Erdgeschoss

Anfahrt

in Berlin:

m it der Bahn:
  • mir der DB zum Bahnhof Berlin Ostbahnhof, dann weiter wie oben
m it dem Flugzeug:
  • am nächsten liegt der Flughafen Berlin-Schönefeld (SXF)
  • ca. 10min Fußweg zum S-Bahnhof Flughafen Schönefeld, überdachter Säulengang und Tunnel
  • von dort die S9/S45 in Richtung Grunewald/Gesundbrunnen bis zur Haltestelle Adlershof (drei Stationen)

  • vom Flughafen Berlin Tegel (TXL)
  • mit dem Bus X9 zum S+U-Bahnhof Jungfernheide (ca. 5min)
  • von dort mit der S46 in Richtung Königs Wusterhausen bis zur Haltestelle Adlershof (ca. 40min)

  • vom Flughafen Berlin Tempelhof (THF)
  • zu Fuß oder mit dem Bus 104 zum Platz der Luftbrücke (ca. 3 bzw. 1min).
  • dort in die U6 in Richtung Alt-Mariendorf bis zum S+U-Bahnhof Tempelhof (ca. 3min)
  • weiter mit der S45 in Richtung Schnönefeld, bis zur Haltestelle Adlershof (ca. 15min)

  • dann jeweils weiter wie oben
m it dem Auto:


Hotels

IBIS Hotel Adlershof

Rudower Chaussee 15
12489 Berlin
Tel: 030/67822-0
Fax: 030/67822-1000
Drahtlose Datenübermittlung


Webseite/Online-Reservierung
Bei reservierten Zimmern: Anreise 15:00-19:00 Uhr, ansonsten bitte per Telefon Bescheid geben.
Bushaltestelle: Walther-Nernst-Straße

IB-Hotel Am Campus

Rudower Chaussee 14
12489 Berlin
Tel: 030/75656-0
Fax: 030/75656-155



Webseite
Bei reservierten Zimmern: Anreise 15:00-20:00 Uhr, ansonsten bitte per Telefon Bescheid geben.
Bushaltestelle: Walther-Nernst-Straße

This meeting is hosted by the Berlin Center for Genome Based Bioinformatics, BCB.