Bioinformatik für Biophysiker
Bioinformatik für Biophysiker
Vorlesung im Sommersemester 2009
Prof. Herzel, Prof. LeserDie Vorlesung behandelt grundlegende Fragestellungen moderner Bioinformatik. Sie wird ergänzt um eine vorlesungsbegleitende Übung. Voraussetzung zum Erhalt eines Scheines ist das Bestehen einer Klausur; die Übung ist fakultativ.
Ort / Zeit:
Freitags, 11.00 - 14.00 UhrIm ersten Teil (Prof. Herzel) des Semesters findet die Vorlesung im
Zentrallabor, Invalidenstr. 42 statt
Im zweiten Teil (Prof. Leser/Silke Trißl, ab dem 5.6.2009) findet die
Vorlesung in Adlershof statt (Raum: RUD 25, 3.113)
Literatur zur Vorlesung
Abschnitt Prof. Leser: Dan Gusfield, "Algorithms on Strings, Trees, and Sequences", Cambrige University Press
Themen der Vorlesung
- Prof. Herzel: tba
- 5.6.2009: Prof. Leser: Einleitung, Zeichenketten und Bioinformatik, Z-Box Algorithmus
- 12.6.2009: Approximatives
Stringmatching, lokales Alignment,
Aufgabenblatt 4
- 19.6.2009: Substitutionsmatrizen und BLAST, Aufgabenblatt 5
- 26.6.2009: Übung - Sequenzen - Korrektur Aufgabenblatt 4 -
Java-Code
- 3.7.2009: BLAT und multiples Sequenzalignment
- 10.7.2009: Übung - Sequenzen - Korrektur Aufgabenblatt
5 - Java-Code - Daten
- 17.7.2009: Phylogenie
- Donnerstag, 30.7.2009, 14-16 Uhr: Klausur, Hörsaal 12
